La familia de bacterias Prevotella puede ser un factor determinante en la gravedad de los síntomas de Covid-19
Por: Igaal Hanouna
Prefacio
El propósito de este artículo es dar nuevas vías de investigación al mundo científico con respecto a la investigación sobre el Covid-19.
Este artículo está inspirado en el trabajo de Sandeep Chakraborty y Bio Moon, quienes presentaron la hipótesis de la bacteria Prevotella como un factor que discrimina las formas de Covid-19.
Llamo la atención del lector sobre el hecho de que no soy ni un médico habitual ni un experto médico habitual. Lo mismo ocurre con los inventores de esta hipótesis Sandeep Chakraborty y Bio Moon.
Mi objetivo aquí es transmitir, discutir, enmendar y hacer referencia a su trabajo. En este sentido, me uno a ellos en una lógica fructífera de trabajo colaborativo.
Mi contribución a este trabajo será exponer esta hipótesis de la manera más discutida posible para convertirla en un artículo básico sobre el tema.
Una vez más, le recuerdo al lector que tomo esta hipótesis en mi cuenta personal sin comprometer ni la responsabilidad de Sandeep Chakraborty ni la de Bio Moon.
No dejaría de decir que están en el origen de esta idea. Sandeep Chakraborty y Bio Moon plantearon la hipótesis del papel de Prevotella en Covodi-19.
Por lo tanto, deseo continuar su trabajo y destacar ciertas subespecies de esta familia de bacterias Prevotella (en particular, Prevotella Copri) mientras establezco una hipótesis lo más completa y documentada posible.
Finalmente, invito a investigadores, médicos y a todos los que quieran participar en este proyecto a contradecir esta tesis con la mayor fuerza posible.
Es por contradicción en la ciencia que la verdad científica a menudo surge.
Introducción
La investigación mundial está llevando a cabo estudios experimentales sobre Covid-19. Aquí no tenemos la intención de reemplazar el trabajo de verificación y administración de evidencia.
Nuestra voluntad es solo establecer una hipótesis de trabajo que pueda explicar la sorprendente diversidad con la que se expresa la patogenicidad del virus Covid-19.
También nos parece que esta investigación científica se ha vuelto hiperespecializada y que, por lo tanto, puede carecer de una visión global sobre todo el tema.
El énfasis desproporcionado en la biología celular nos desconcierta. Nos parece que nos centramos en el estudio de los mecanismos sin siquiera preguntarnos si estamos trabajando en un reloj.
Por lo tanto, nuestro enfoque consiste en observar la investigación mundial y beber de sus publicaciones para ver si en un esfuerzo de síntesis puede emitir una vía útil de investigación.
Esta ruta de investigación es la ruta bacteriana, y más precisamente la ruta de la familia de bacterias Prevotella Copri. En aras de la simplificación lingüística, abreviaremos Prevotella.
Nuestro enfoque consistirá en primer lugar en mostrar que esta hipótesis permite superponer de manera bastante relevante los perfiles epidemiológicos de acuerdo con la severidad observada de los síntomas.
En segundo lugar, propondremos un escenario de infección general para la enfermedad, así como ciertos mecanismos que podrían implementarse.
I. El perfil epidemiológico de las formas de Covid-19 a través del prisma de la bacteria Prevotella
En el estado actual de la investigación, no hemos encontrado ninguna publicación u observación simple de retroalimentación que demuestre la imposibilidad de que un ser humano se infecte con Covid-19.
En este sentido, el perfil viral por infección convencional de una célula humana parece ser adquirido.
Lo que nos cuestiona es la diversidad de la sintomatología dependiendo de las personas involucradas.
a. La vía viral nos permite explicar las formas asintomáticas o leves de expresión de síntomas.
Lo que más sorprende a los virólogos es que, con la excepción de SARS-Covid 1 y MERS, los coronavirus convencionales no parecen ser virulentos.
Como primera aproximación, los síntomas de un coronavirus “clásico” son similares a los de un resfriado: secreción nasal, tos seca, dolor de garganta, nasofaringitis, fatiga, dolor muscular, dolor de cabeza, fiebre leve, ageusia ( pérdida del gusto) o anosmia (pérdida del olfato)
Por lo tanto, uno podría pensar que Covid-19 no es una excepción a la regla y que es responsable de este tipo de síntomas leves.
Dada la naturaleza inofensiva de estos síntomas, uno puede imaginar que esta forma viral única del coronavirus Covid-19 explica este tipo de síntomas.
b. La huella bacteriana de Prevotella explica las formas graves de Covid-19
Para simplificar el punto, enumeraremos las observaciones hechas por la comunidad científica y veremos si esto coincide con nuestra hipótesis.
yo. El perfil bacteriano es un marcador de ecosistemas.
Los epidemiólogos en su conjunto admiten que una epidemia solo puede concebirse en un ecosistema, es decir, debe considerarse a la luz del medio ambiente (biotopo), de todas las especies que conviven ( biocenosis) y nuestro estilo de vida.
A través de nuestra lectura, hemos adquirido la convicción de que el ambiente bacteriano es un marcador muy importante de los ecosistemas.
Sobre este punto, la literatura científica es abundante y nuestra convicción no parece enfrentar ningún desafío en particular.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3602444/
El ambiente bacteriano que influye en la fauna y la flora, no puede permanecer neutral en nuestros ecosistemas.
Creemos que es probable que el ambiente bacteriano juegue un papel en la epidemia de Covid-19.
Entre las innumerables bacterias que coexisten en nuestros ecosistemas, la bacteria Prevotella y más específicamente su subespecie Prevotella Copri nos llamó la atención por varias razones.
ii. La prevalencia geográfica de Prevotella Copri encaja bien con las áreas geográficas de prevalencia de la epidemia.
Como primera aproximación, observamos que los países más afectados por la epidemia de Covid-19 son Europa continental, Estados Unidos, parte de Asia y América del Sur de manera desigual (áreas costeras) .
En un estudio titulado ” El complejo de Prevotella copri comprende cuatro clados distintos subrepresentados en las poblaciones occidentalizadas”, la subespecie de Prevotella Copri se estudia en particular en su prevalencia geográfica.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1931312819304275
Muestra que la prevalencia de Prevotella Copri se superpone ampliamente a las áreas geográficas de la epidemia.
Aquí hay una información gráfica para observar el alcance de la pandemia.
https://news.google.com/covid19/map?hl=fr&gl=FR&ceid=FR:fr
Compare con la tabla esquemática que resume la prevalencia de la bacteria Prevotella Copri.
La superposición de las dos cartas, por lo tanto, parece lo suficientemente buena como para no rechazar la idea de que la familia Prevotella Copri juega un papel en la epidemia.
Tenga en cuenta que Prevotella Copri tiene 4 subespecies llamadas subespecies A, B, C y D.
La conclusión que sacamos de estas observaciones es que la ausencia de los dos subgéneros C y / o D de la familia Prevotella podría explicar lo que observamos.
Tratemos de ver si esta hipótesis resiste ciertas observaciones.
iii) La prevalencia de dos subgéneros de Prevotella Copri puede explicar los datos estadísticos generales de la epidemia.
Observamos que, por lo tanto, existe una superposición geográfica entre la ausencia de 2 subgéneros de Prevotella Copri y la epidemia de Covid.
En términos de población, esto representa el 30% de la población afectada (países desarrollados occidentalizados).
En estos países desarrollados occidentalizados, actualmente y en ausencia de datos estables, los estadísticos estiman que:
50% de formas asintomáticas
10% a 15% de formas graves de Covid-19 que requieren hospitalización
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMe2009758
Sin embargo, la imprecisión persiste y los sesgos estadísticos son numerosos.
Sin embargo, podemos pensar que, como primera aproximación, hay alrededor del 35% de las personas que tienen formas leves o graves que no requieren hospitalización.
Estadísticamente, por lo tanto, tenemos una aproximación aceptable que no invalida la hipótesis.
En otras palabras, el número de personas afectadas por formas moderadas o severas parece compatible estadísticamente con el número de personas sin subespecies C y / o D de Prévotella Copri.
iv. La prevalencia de Prevotella por edad parece tener un vínculo estadístico con la gravedad de los casos observados.
El estudio de referencia sobre Prevotella Copri ” El complejo Prevotella copri comprende cuatro clados distintos subrepresentados en poblaciones occidentalizadas” proporciona información sobre la prevalencia de la bacteria Prevotella Copri y sus 4 subespecies según la edad.
Por lo tanto, vemos que, como regla general, la prevalencia de Prevotella Copri disminuye con la edad para todas sus especies.
Ahora encontramos en Covid-19 que la gravedad de los síntomas observados aumenta con la edad.
https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/69/wr/mm6915e3.htm
Nuevamente, parece haber un vínculo estadístico entre la prevalencia de Prevotella Copri, la edad y la gravedad de los síntomas observados.
Sin embargo, no es posible inferir a partir de esta tabla supuestos sobre las subespecies involucradas.
También se observa que la proporción de Prevotella Copri de cepas A remo en comparación con otras cepas aumenta con la edad.
Por lo tanto, podemos preguntarnos si la sobrerrepresentación de Prevotella Copri A en ausencia de Prevotella Copri C / D puede explicar lo que vemos en el perfil epidemiológico.
v. La prevalencia de Prevotella por peso parece tener un vínculo estadístico con la gravedad de los casos observados.
El estudio de referencia sobre Prevotella Copri ” El complejo Prevotella copri comprende cuatro clados distintos subrepresentados en poblaciones occidentalizadas” proporciona información sobre la prevalencia de la bacteria Prevotella Copri y sus 4 subespecies según el peso.
Por lo tanto, vemos que, como regla general, la prevalencia de Prevotella Copri disminuye al aumentar el peso de todas sus especies.
Ahora encontramos que el Covid-19 indica que la gravedad de los síntomas observados aumenta con el peso.
En este caso, cuanto mayor sea la masa grasa, más probabilidades hay de tener una forma grave de Covid-19
Nuevamente, parece haber un vínculo estadístico entre la Prevalencia de Prevotella, el peso y la gravedad de los síntomas observados.
No es posible inferir de esta tabla hipótesis sobre las subespecies involucradas, pero parece que la subespecie A todavía está involucrada.
Al final, sin embargo, no podemos formular algunas hipótesis adicionales:
· Las especies A y / o B son patógenas en contacto con Covid-19
· Las especies C y / o D son protectoras en contacto con Covid-19
· Existe una relación de equilibrio entre A y / o B por un lado y C y / o D por el otro, lo que implica una expresión particular de las subespecies A y / o B. Dependiendo de este equilibrio, A y / o B puede ser saludable o volverse patógeno.
Dado que las personas con las 4 subespecies parecen estar menos afectadas a nivel geográfico global, concluimos que es la caída en la prevalencia de las especies C y / o D lo que explica la gravedad de los síntomas.
También podemos pensar simétricamente que es el aumento proporcional de Prevotella Copri tipo A el que tiene un efecto patogénico.
vi. La prevalencia de Prevotella Copri no parece a priori no discriminatoria con respecto a los otros factores de comorbilidad
El estudio de referencia sobre Prevotella Copri ” El complejo de Prevotella copri comprende cuatro clados distintos subrepresentados en poblaciones occidentalizadas” evoca 10 conjuntos de datos que tienden a establecer vínculos entre Prevotella Copri y factores de comorbilidad.
Estos factores de comorbilidad son:
· Cáncer colorrectal (CCR): Feng et al., 2015 , Vogtmann et al., 2016 , Yu et al., 2017 , Zeller et al., 2014
Diabetes tipo 2: Karlsson et al., 2013 , Qin et al., 2012
Hipertensión: Li et al., 2017
Cirrosis hepática: Qin et al., 2014
Enfermedad inflamatoria intestinal: He et al., 2017 , Nielsen et al., 2014
Sin embargo, dada la heterogeneidad de los datos, los autores del estudio de referencia no pueden concluir claramente que una o más de las subespecies mencionadas están involucradas.
Sin embargo, observamos que los factores mencionados en la literatura científica se superponen con los factores de comorbilidad observados para Covid-19:
Para el cáncer colorrectal: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7170009/
Para diabetes e hipertensión: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7144598/
Para la cirrosis hepática: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7166301/
Enfermedad inflamatoria intestinal: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7174834/
De manera más general: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7151343/
Estos son elementos que deben evaluarse en la evaluación de nuestra hipótesis, incluso si el vínculo no está firmemente establecido por el momento.
vii. La prevalencia de Prevotella Copri puede tener una influencia de género en las personas con Covid-19
La literatura científica ha observado que la artritis reumatoide afecta a las mujeres más que a los hombres (alrededor del 75%).
También muestra que esta enfermedad empeora con la expansión de Prevotella Copri en el intestino.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/?term=prevotella+copri+arthritis+clade
Prevotella Copri, por lo tanto, no es neutral en términos de género en general.
Sin embargo, observamos que las mujeres parecen verse menos afectadas por Covid-19.
Sin embargo, en el estado actual de las cosas, es imposible llegar a una conclusión definitiva porque otros factores pueden influir en el género (peso, factores genéticos, etc.).
Aquí nuevamente, sin embargo, la hipótesis de Prevotella Copri no puede ser invalidada antes de una investigación adicional.
Por lo tanto, pido a los investigadores que se apoderen del tema para probar estas hipótesis.
c. La huella bacteriana puede explicar los casos límite observados
yo. La hipótesis de Prevotella Copri explica ciertos fenómenos de grupos que parecen inesperados.
Los estudios de síntomas intestinales son muy dispares y dejan perplejos a los observadores.
Las tasas de diarrea sintomática parecen cambiar de un estudio a otro sin explicación. Una publicación china que compila otros estudios que enumeran los síntomas intestinales muestra que los casos de diarrea en pacientes se pueden entender en 2% y 49.5% según las muestras comparadas.
Esto podría ser un desafío de sentido común dados los otros estudios.
Sin embargo, en nuestro modelo bacteriano, estos dos casos se explican de manera bastante fluida.
Para los casos chinos, esto puede explicarse por las dietas que pueden variar según la región o si usted es un habitante de la ciudad o un agricultor.
Además, se ha encontrado en los Estados Unidos que 3.277 prisioneros en 4 prisiones diferentes han dado positivo pero que el 96% de ellos no han mostrado síntomas.
https://www.reuters.com/article/us-health-coronavirus-prisons-testing-in-idUSKCN2270RX
Sin embargo, en teoría, deberíamos tener un panel de pacientes entre 18 y 70 años, con una sobrerrepresentación de afroamericanos. Además, no se espera que el estado general de salud de estos prisioneros sea particularmente bueno. Sin embargo, dado que los afroamericanos en Nueva York no parecen estar particularmente afectados por la epidemia, podemos suponer que existe un tipo especial de ecosistema carcelario.
Uno de los puntos comunes de todos estos prisioneros es que a priori tienen la misma dieta y, por lo tanto, deben tener un perfil de microbiota similar.
La particularidad de la comida de la prisión es que está deliberadamente equilibrada, bastante baja en grasas y calorías.
Esto es lo que está escrito en Wikipedia: “los menús típicos están diseñados para ser bajos en azúcar, bajos en sal y para contener una cantidad moderada de calorías”.
También hemos examinado algunos artículos de prensa que tienden a mostrar que los detenidos no están comiendo lo suficiente, lo que ha provocado protestas.
https://www.themarshallproject.org/2015/07/07/what-s-in-a-prison-meal
Esto queda por demostrar formalmente estudiando las comidas, pero podemos poner esta hipótesis.
Por lo tanto, conjeturamos que existe una probabilidad no despreciable de que estas personas tengan una microbiota bastante rica en Prevotella Copri de los tipos C y / o D, como los países pobres no industrializados.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4828855/
Por lo tanto, esto encaja bien con nuestra hipótesis.
En términos más generales, la literatura informa numerosos estudios que comprenden muestras locales destinadas a evaluar lo asintomático.
Lo sorprendente es la variación entre las diferencias observadas entre 18% y 80%.
https://www.cebm.net/covid-19/covid-19-what-proportion-are-asymptomatic/
Solo un enfoque que tenga en cuenta los ecosistemas puede ayudar a comprender esto.
Esto fortalece el rastro bacteriano.
ii. La hipótesis de Prevotella explica que las personas con fibrosis quística están paradójicamente menos afectadas
En una entrevista dada en un medio francés, Jean-Marc Treluyer especifica que las personas con fibrosis quística tienen menos formas graves mientras sufren una enfermedad respiratoria significativa.
Es contradictorio.
Sin embargo, “Prevotella se encuentra persistentemente en el esputo de pacientes con fibrosis quística” (Bacteriología médica: técnicas habituales; François Denis, Vincent Cattoir, Christian Martin, Marie-Cécile Ploy, Claire Poyart).
Por lo tanto, los pacientes con fibrosis quística son tratados con antibióticos para controlar la proliferación de Prevotella.
En el espectro, es posible que la subespecie A y / o B de Prevotella (aquellos cuya sospecha de naturaleza patógena se sospecha) se elimine por completo con la terapia con antibióticos, que de hecho limita la interacción con el virus.
iii) La hipótesis de Prevotella explica que las personas con EII (enfermedad inflamatoria intestinal) están más afectadas
Además, un estudio de 1.099 pacientes con Covid-19 en 552 hospitales chinos ha mostrado un vínculo entre el coronavirus y la enfermedad inflamatoria intestinal, como la enfermedad de Crohn. Los pacientes que ya padecen dicha enfermedad parecen más propensos a desarrollar una forma grave de Covid-19. Los investigadores especulan que el desequilibrio de la flora intestinal en estos pacientes podría promover el proceso inflamatorio inducido por el coronavirus y, por lo tanto, empeorar sus síntomas.
https://www.thelancet.com/journals/langas/article/PIIS2468-1253(20)30076-5/fulltext
Una vez más, estos pacientes, y más específicamente aquellos con enfermedad de Crohn, tienen perfiles de microbiota que demuestran un desequilibrio de Prevotella Copri, pacientes con menos Prevotella.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4633303/
Podemos hipotetizar que las subespecies de Prevotella Copri C y / o D están menos presentes, y todo esto queda por verificar.
iv. La hipótesis bacteriana de Prevotella ayuda a explicar por qué Tocilizumab e Ivermectin podrían tener un efecto sobre Covid-19
Al momento de escribir este artículo, las noticias de AP-HP anuncian que “Tocilizumab mejora significativamente el pronóstico de los pacientes con neumonía COVID moderada o grave”.
Tocilizumab es un medicamento administrado a personas con artritis reumatoide.
Sin embargo, esta enfermedad empeora con la expansión de Prevotella Copri en el intestino. La correlación se establece estadísticamente en este punto.
https://elifesciences.org/articles/01202
Por lo tanto, el tocilizumab probablemente reduce los efectos nocivos de Prevotella Copri.
Además, el tocilizumab y la ivermectina (que serían efectivos según los investigadores japoneses) tienen efectos antiinflamatorios al bloquear la producción de IL-6, que tiene un papel en la proliferación de Prevotella Copri (ver más abajo). )
v. La enfermedad de Kawasaki se caracteriza por una menor prevalencia de la bacteria Prevotella Copri
Al momento de escribir este artículo, el Hospital Necker está reportando el supuesto aumento de la enfermedad de Kawasaki.
Esta enfermedad se caracteriza por un perfil intestinal bacteriológico desequilibrado. La prevalencia de Prevotella Copri es más baja allí, como lo demuestran los científicos japoneses.
“La clasificación del género bacteriano de las muestras P1–4AS y P1–4AP, que se recolectaron antes del tratamiento con IVIG, mostró que las secuencias bacterianas más abundantes eran de miembros del género Streptococcus en ambas muestras (Fig. 2c). El coeficiente de determinación de las lecturas bacterianas totales entre las muestras P1–4AS y P1–4AP fue de 0.6633. En particular, Streptococcus y Haemophilus spp. se identificaron significativamente en ambas muestras, mientras que las bacterias anaeróbicas como Prevotella y Veillonella se observaron a un nivel reducido en suero (P1–4AS), lo que indica que las bacterias resistentes al suero como Streptococcus spp. podría ser más frecuente que las bacterias sensibles al suero “.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5343132/
Nuevamente, este tipo de enfermedad con la que detectaríamos una correlación estadística de ocurrencia con Covid-19 presenta una tabla que muestra una anomalía en la prevalencia de Prevotella.
Como vemos, la hipótesis construida alrededor de la bacteria Prevotella Copri como factor patogénico que discrimina las formas graves de Covid-19 es robusta.
Por lo tanto, nuestra hipótesis principal es que las subespecies A y / o B de Prevotella pueden volverse patógenas en el contexto de contacto o interacción con Covid-19.
II Escenario de infección general de Covid-19 bajo la influencia de Prevotella
a. Covid-19 parece experimentar una fase de incubación en contacto con Prevotella Copri, lo que lo hace aún más patógeno.
Covid-19, por lo tanto, entraría en el cuerpo como un clásico Coronavirus.
Este aspecto viral explicaría los síntomas leves descritos anteriormente.
Los síntomas ligeramente más graves observados en la esfera ENT, como la periodontitis, también podrían explicarse por las colonias de Prevotella presentes en la microbiota oral.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8941760/?from_term=prevotella+distribution+age&from_pos=5
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1151961/
El Covid-19 luego pasaría a la tráquea, donde se encontraría con otras especies de bacterias Prevotella que a veces se sabe que causan angina bacteriana como se observa en los síntomas.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7151343/
Una vez presente en el intestino, Covid-19 podría interactuar con la bacteria Prevotella Copri, alterar el equilibrio de la microbiota y crear disbiosis.
Esto explicaría la diarrea a veces larga y severa, ya que se sabe que Prevotella Copri es una bacteria comensal presente en grandes cantidades en el intestino para aquellos que son portadores.
Una vez en el intestino, Covid-19 y Prevotella Copri iniciarían intercambios microcelulares cuya verdadera naturaleza se desconoce hasta la fecha.
Lo que encontramos sorprendentemente es que la acción de Covid-19 ayudaría a eliminar la bacteria Prevotella presente en el cuerpo de aquellos que tienen una microbiota pobre en Prevotella Copri tipo C / D.
Covid-19 atacaría, por lo tanto, principalmente a la subespecie A y / o B de Prevotella Copri.
Pero volvamos al estudio de referencia titulado “El complejo Prevotella copri comprende cuatro clados distintos subrepresentados en las poblaciones occidentalizadas”.
En este estudio, los autores nos proporcionan un conjunto de datos de 42 perfiles bacterianos para Prevotella Copri con respecto a 42 individuos de diferentes países.
https://ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0-S1931312819304275-mmc3.xlsx
De estas 42 personas, todas tienen al menos un 2% de Prevotella Copri. 6 de 42 tienen más del 10% en sus intestinos.
Para el grupo de personas chinas, tenemos 6 personas en la lista. Los 6 están por encima del 25%, el promedio es del 33,9% (con poca variación).
Otro estudio sobre el enterotipo de 13 individuos voluntarios chinos también muestra la presencia sistemática de Prevotella Copri en las heces, incluso si su prevalencia es variable según los individuos.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5554170/#MOESM1
En general, se puede suponer que las cohortes de Prevotella Copri commensales están acompañadas por cohortes de otras subespecies de Prevotella presentes en otros lugares en el mismo individuo.
(En este punto, no he encontrado ninguna literatura relevante en este momento y, por lo tanto, presumiblemente debo asumirlo).
Si este virus fuera neutral con respecto a Prevotella, podríamos esperar que se encuentre Prevotella en pacientes con Covid-19 como aquellos que no lo son.
Sin embargo, un estudio científico chino estudió el ARN de 10 muestras de pacientes chinos con formas graves de Covid-19. Estos 10 estudios cubren diversos entornos del cuerpo humano.
De los 10 estudios, aquí está el recuento de bacterias Prevotella (todas las subespecies se combinan):
· Muestra 1 en la garganta: 0.4% Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454606
· Muestreo 2 en las heces: 0.01% de Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454607
· Muestra 3 en la garganta: 0% Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454608
· Muestreo 4 en la garganta: 0% Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454609
· Muestreo 5 en la garganta: 0% Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454610
· Muestreo 6 en la garganta: 17.9% de Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454611
· Muestreo 7 en excreciones: 6.5% de Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454612
· Muestreo de 8 frotis de los bronquios: 0% Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454613
· Muestra 9 del lavado broncoalveolar :: 0% de Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454614
· Muestreo 10 del lavado broncoalveolar :: 2% de Prevotella https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR11454615
Con la excepción de una sola muestra, la presencia de Prevotella no se correlaciona significativamente con la de un paciente sano.
Esta relativa ausencia de bacterias Prevotella nos lleva a cuestionarnos a nosotros mismos.
De hecho, tenemos en la literatura 2 grupos de control para las heces. Sin embargo, en estos grupos de control siempre existe la presencia de Prevotella Copri.
Por lo tanto, es estadísticamente bastante improbable que la muestra fecal tomada del paciente gravemente afectado por Covid-19 no contenga Prevotella.
Por supuesto, es posible que el paciente haya tomado antibióticos que eliminen Prevotella Copri, pero en este caso suponemos que el estudio nos lo habría informado por un lado, y que otras bacterias también deberían haber desaparecido, lo que No parece ser el caso.
Estas observaciones, suponiendo que se verifiquen en muestras más grandes, sugieren que Prevotella está “lisado” bajo la influencia del virus.
Por lo tanto, esta hipótesis debe verificarse en muestras de heces tomadas en varias etapas de la enfermedad.
Que yo sepa, no hay muchos datos disponibles sobre las series de heces de pacientes con Covid-19. El publicado por investigadores chinos está buscando patógenos ( Salmonella, Shigella, Escherichia coli y Clostridium difficile) y no Prevotella Copri, que se sabe que es una bacteria comensal no patógena.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7126982/
En un estudio llamado “Una bacteria Listeria monocytogenes puede apuntar a la Prevotella copri comensal y modular la infección intestinal”, el Institut Pasteur demostró que un gen bacteriano llamado LMO2776 podría atacar y destruir Prevotella Copri.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6854461/
Por lo tanto, podemos imaginar un proceso idéntico al descrito aquí. Sin embargo, nos falta cultura en biología molecular para entender por qué mecanismo de activación podría haber comenzado la “lisis” de Prevotella.
Esta lisis también parece explicar el hecho de que Covid-19 pudo recuperar material genético de Prevotella.
El análisis de ARN del virus muestra más del 30% de secuencias comunes con la bacteria Prevotella.
https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?run=SRR10971381
¿Es un artefacto de medición?
Es posible pero no lo creemos.
Sandeep Chakraborty también notó esta peculiaridad en sus obras. Identificó varias secuencias de Covid-19 llevadas a cabo en varios lugares (China, Brasil, Perú, Camboya) donde notó la presencia de secuencias genéticas de Prevotella en el genoma del virus.
Por lo tanto, tenemos varias secuencias independientes que parecen indicar que el Covid-19 ha incorporado parte del material genético.
b. Covid-19 parece haber incorporado parte del material genético de la bacteria Prevotella
Prevotella Copri también es conocido por su efecto inflamatorio sobre el epitelio intestinal. Prevotella Copri estimula las células epiteliales que producen interleucina IL-6, y se sabe que la interleucina IL-6 tiene una acción inflamatoria.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5506432/
Por lo tanto, es probable que esta misma interleucina IL-6 se encuentre en las reacciones inflamatorias de Covid-19.
En otras palabras, Covid-19 habría integrado la proteína de Prevotella que estimularía a través de su acción sobre las células epiteliales la producción de interleucina IL-6.
Una vez cargado con material inflamatorio Prevotella, Covid-19 atravesará la barrera intestinal para extenderse a través del torrente sanguíneo a través de los vasos y por todo el sistema epitelial.
A medida que Covid-19 asume esta función inflamatoria del epitelio intestinal, la inflamación puede extenderse a todos los vasos del cuerpo.
Luego presenciamos una inflamación vascular sistémica de los vasos, una inflamación que conduce a la observación de todas las formas graves que conocemos.
Esto es lo que describió el equipo suizo del profesor Ruschitzka.
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30937-5/fulltext
Según el profesor Ruschitzka, Covid-19 debería incluso llamarse “Covid epitelial” porque causa inflamación de todos los tejidos del epitelio.
Conclusión
Por lo tanto, el aspecto inflamatorio causado por Covid-19 en el epitelio sería el resultado de una interacción con la bacteria Prevotella Copri y, más precisamente, la subespecie A definida en el estudio de referencia ” El complejo Prevotella copri comprende cuatro clados distintos Subrepresentada en las poblaciones occidentalizadas ” .
Este aspecto bacteriano nos permite comprender mejor el perfil epidemiológico muy diverso que observamos.
En general, la epidemia golpeará a los llamados países modernos y occidentalizados con mayor violencia.
Este modelo, si se valida, permitiría identificar a las personas en riesgo a través de un análisis de heces y un estudio de ARN de la subespecie Prevotella de la subespecie Prevotella para observar su distribución.
También permite vislumbrar vías de tratamiento profiláctico basado en probióticos para modificar la prevalencia de subespecies patógenas de Prevotella en contacto con Covid-19 (incorporando, por ejemplo, subespecies de Prevotella C y D).
También hace posible prever tratamientos antibióticos ad-hoc dirigidos a Prevotella (antibióticos dirigidos a bacterias anaerobias gramnegativas).
También hace posible administrar tratamientos complementarios para controlar el riesgo de tormenta de citoquinas ligadas a interleucinas IL-6 como Tocilizumab (este fármaco podría permitir además controlar el crecimiento de Prevotella a largo plazo y tener También un efecto profiláctico).
Sin embargo, hay una sombra sobre el mecanismo por el cual Covid-19 puede transportar material genético de Prevotella. Este mecanismo aún no se ha estudiado y Bio Moon está desarrollando una tesis muy iconoclasta sobre el tema que no deja de exponer en otra parte.
Si se ha verificado este potencial para transportar material genético de Prevotella, parece que el virus podría mutar muchas veces. Esto es lo que un estudio chino nos sugiere sobre el tema.
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.14.20060160v1.full.pdf
En este caso, el rastro de la vacuna podría resultar infructuoso.
Sería mejor centrar nuestros esfuerzos en un tratamiento efectivo (tratamiento de EII o enfermedades autoinmunes) y en la prevención cambiando nuestros hábitos alimenticios.
Covid-19 podría convertirse en un nuevo paradigma para las industrias alimentarias de los países industrializados.
Agradecimientos
Primero me gustaría agradecer a Bio Moon. Todo el crédito por este artículo va para él. Y si mis hipótesis resultaron ser correctas, me gustaría aclarar que a él y a Sandeep Chakraborty les corresponde el crédito por haber encontrado la pista de Prevotella y por haber explicado la mayoría de los mecanismos.
También explico aquí toda nuestra odisea colaborativa.
También quiero agradecer al lector por tomarse el tiempo de leerme.
Sé que este texto irritará a los científicos profesionales porque no respeta los códigos recomendados por las revistas científicas. Pido disculpas de antemano. Solo espero que te inspire y te dé ideas al contradecirlo.
También invito a todos a abordar todos los temas que son queridos por sus corazones con valentía y sin temor al fracaso.
Tal vez nuestras suposiciones están equivocadas, pero tienen el mérito de haber sido formuladas sin temor a equivocarse.
No somos nada científicamente, y si nos equivocamos no seremos ridículos.
La ciencia no le pertenece a nadie, es obra de la humanidad.
